Родился 13 мая 1963 года в городе Кызылорда.
В 1984 году окончил Алматинский институт народного хозяйства по специальности "Бухгалтерский учет и анализ хозяйственной деятельности".
Е.Бердибаев родился в Кызылорде. Трудовой путь начал в 1984 году в качестве инспектора государственных доходов в Жанакорганском районном отделе финансов.
В 1986-1987 годы работал экономистом госдоходов в райотделе финансов, в 1987-1989 годы – учителем в средней школе №239 аула Кенес, в 1989-1992 годы – главным экономистом совхоза Талап Жанакорганского района.
В 1992-1996 годы – заведующий отделом комитета экономики при акимате Жанакорганского района, старший ревизор, контролер комитета финансового контроля района.
В 1996-1998 годы работал в комитете финансов Кызылординской области, в 1998-2009 годы – в областной налоговой полиции. В 2010-2014 годы был директором учебного центра «Болашак-Шиели», руководителем участка №23 геологической научной экспедиции. В 2014-2015 годы – руководитель Кызылординского городского отдела жилищной инспекции, в 2015-2017 годы – руководитель Кызылординского городского отдела ЖКХ и жилищной инспекции.
В 2017-2019 годы – руководитель отдела административно-правовой работы управления государственного архитектурно-строительного контроля Кызылординской области. В 2019-2020 годы был заместителем акима Кызылорды.
С 2020 года до настоящего времени занимал должность руководителя Кызылординского департамента государственного имущества и приватизации Комитета госимущества и приватизации Министерства финансов РК.